Infos Biotech – Un éditeur de base CRISPR double désaminase permet l’édition simultanée d’adénine et de cytosine– Act-in-biotech

  • une)

    Komor, A. C., Kim, Y. B., Packer, M. S., Zuris, J. A. et Liu, D. R. Édition programmable d’une base cible dans l’ADN génomique sans clivage d’ADN double brin. La nature 533420-424 (2016).

    CAS
    Article

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  • 2)

    Gaudelli, N. M. et al. Édition de base programmable de A * T à G * C dans l’ADN génomique sans excision d’ADN. La nature 551, 464–471 (2017).

    CAS
    Article

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  • 3)

    Komor, A. C. et al. Inhibition accrue de la réparation du clivage de la base des bactériophages et du rendement en protéine Mu Gam C: G-to-T: éditeurs de base avec une pureté et une efficacité accrues du produit. Sci. Adv. 3, eaao4774 (2017).

    Article

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  • 4)

    Rees, H. A. et Liu, D. R. Édition de base: chimie de précision dans le génome et le transcriptome des cellules vivantes. Rév. Nat. Genet. 19, 770–788 (2018).

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  • 5)

    Nishida, K. et al. Édition de nucléotides dirigée par des systèmes immunitaires adaptatifs procaryotes et vertébrés hybrides. Science 353, aaf8729 (2016).

    Article

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  • 6)

    Grünewald, J. et al. Rédacteurs CRISPR DNA Base avec réduction de l’ARN hors cible et des activités de PAO. Nat. Biotechnologie 37, 1041-1048 (2019).

    Article

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  • 7)

    Grünewald, J. et al. Édition d’ARN hors cible du transcriptome entier induit par des éditeurs de base d’ADN guidés par CRISPR. La nature 569, 433-437 (2019).

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  • 8)

    Tsai, S. Q. et al. GUIDE-seq permet la génération de profils de clivage hors cible par les nucléases CRISPR-Cas. Nat. Biotechnologie 33187-197 (2015).

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  • 9)

    Kaplanis, J. et al. Évaluation de l’exome entier de l’impact fonctionnel et de la pathogénicité des mutations multinucléotidiques. Genome Res. 29, 1047-1056 (2019).

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  • dix)

    Besenbacher, S. et al. Mutations multinucléotidiques de novo chez l’homme. PLoS Genet. 12, e1006315 (2016).

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  • Onze)

    Wang, Q. et al. Paysage de variantes multinucléotidiques dans 125 748 exomes humains et 15 708 génomes. Prépresse en bioRxiv https://doi.org/10.1101/573378 (2019)

  • 12)

    McKenna, A. et al. Traçage de la lignée de l’organisme entier par édition combinatoire et cumulative du génome. Science 353, aaf7907 (2016).

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  • 13)

    Chan, M. M. et al. Enregistrement moléculaire de l’embryogenèse des mammifères. La nature 57077-82 (2019).

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  • 14)

    Canver, M. C. et al. Dissection de l’amplificateur BCL11A par mutagenèse de saturation in situ médiée par Cas9. La nature 527192-197 (2015).

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  • quinze.

    Hess, G. T. et al. Evolution ciblée par hypermutation somatique ciblant dCas9 dans les cellules de mammifères. Méthodes nat. 13, 1036-1042 (2016).

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  • seize.

    Li, C. et al. Mutagenèse ciblée et aléatoire des gènes végétaux avec des éditeurs à double base de cytosine et d’adénine. Nat. Biotechnologie. https://doi.org/10.1038/s41587-019-0393-7 (2020).

  • 17)

    Clement, K. et al. CRISPResso2 fournit une analyse rapide et précise de la séquence d’édition du génome. Nat. Biotechnologie 37, 224-226 (2019).

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  • 18)

    Dobin, A. et al. STAR: aligneur universel ultra rapide RNA-seq. Bioinformatique 29, 15-21 (2013).

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  • 19)

    McKenna, A. et al. The Genome Analysis Toolkit: A MapReduce Framework for Analyzing Next Generation DNA Sequencing Data. Genome Res. vingt, 1297-1303 (2010).

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  • vingt)

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  • vingt et un)

    Karczewski, K.J. et al. Le spectre de restriction mutationnel quantifié à partir de la variation chez 141 456 humains. Préimpression chez bioRxiv https://doi.org/10.1101/531210 (2020) https://storage.googleapis.com/gnomad-public/release/2.1/mnv/gnomad_mnv_coding.tsv

  • 22)

    Mathelier, A. et al. JASPAR 2016: une extension et une mise à jour majeures de la base de données en accès libre des profils de liaison des facteurs de transcription. Nucleic Acids Res. 44, D110 – D115 (2016).

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    Schep, A. N., Wu, B., Buenrostro, J. D. et Greenleaf, W. J. chromVAR: déduire l’accessibilité associée au facteur de transcription à partir de données épigénomiques de cellules individuelles. Méthodes nat. 14, 975–978 (2017).

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  • 24)

    Krzywinski, M. et al. Cirques: informations esthétiques pour la génomique comparative. Genome Res. 19, 1639-1645 (2009).

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