Biotech en Asie – Les scientifiques découvrent le deuxième type de coronavirus le plus répandu en Inde – Act-in-biotech

Les scientifiques de plusieurs laboratoires du CSIR ont identifié un coronavirus type qui est peut-être le deuxième plus répandu en Inde et peut représenter 3,5% des génomes dans le monde.

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Le clade de coronavirus le plus dominant en Inde est l’A2a et sur 361 génomes analysés par le groupe, 45% d’entre eux étaient A2a. Les nouveaux identifiés, que les scientifiques ont baptisés A3i, représentaient 41% de ceux analysés. Avec le nouveau clade, 11 types de SRAS-CoV-2 ont été identifiés dans le monde, dont au moins six en Inde.

Similitudes évolutives

Le type de coronavirus, ou clade, est un groupe de virus SARS-CoV-2 qui partagent des similitudes évolutives et sont regroupés en fonction de mutations caractéristiques ou de similitudes dans certaines parties de leurs génomes.

Ces classifications sont utiles pour déterminer si certaines souches sont particulièrement virulentes, se propager plus facilement, comment elles sont susceptibles d’évoluer dans le temps et si certaines pourraient être moins vulnérables à certains types de vaccins.

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Des études antérieures ont montré que si le type O était la première famille ancestrale du virus identifié en Chine, c’est le type A2a – qui a émergé dominant dans le monde entier en raison d’une mutation dans ses gènes qui permet à la pointe de ce coronavirus d’infiltrer plus efficacement le poumons.

«Les évaluations épidémiologiques suggèrent que l’ancêtre commun [of this subtype of viruses] a émergé au cours du mois de février 2020 et a peut-être entraîné une épidémie suivie d’une propagation dans tout le pays », déclarent les scientifiques du CSIR-Center for Cellular and Molecular Biology et du CSIR-Institute of Genomics and Integrative Biology dans leur article qui n’est pas encore révisé mais disponible sur le serveur de préimpression bioRxiv pour la critique scientifique.

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« Bien que nous nous appuyions sur des échantillons des autorités de l’État, il semble que cela provienne d’une personne à Telangana qui avait voyagé d’Indonésie, de Singapour ou d’un endroit en Asie du Sud-Est », Rakesh Mishra, directeur, CSIR-CCMB, et l’un des les auteurs de l’étude, ont déclaré L’Hindou.

Le type A2i, une fois qu’il a pris racine, est devenu le clade dominant à Telangana ainsi qu’au Tamil Nadu, au Maharashtra et à Delhi, trois États qui comptent parmi ceux qui, mardi, représentent collectivement un peu plus de 1 000 000 cas. L’Inde compte désormais près de 1 90 000 infections confirmées.

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Jusqu’à présent, rien ne prouve que l’A3i soit plus virulent – c’est-à-dire qu’il est lié à plus de décès. «Il est trop tôt pour commenter la virulence en ce moment. Nous sommes en train d’acquérir plus de données, et nous aurons plus de clarté à ce sujet lorsque ces données seront analysées. Cela devrait se faire dans quelques semaines », a déclaré Divya Tej Sowpati, co-auteur et scientifique au CCMB. L’Hindou dans un e-mail.

«Le clade A3i se démarque des autres clades en raison de différences à quatre endroits différents dans sa séquence. De plus, nos analyses suggèrent que le clade A3i mute lentement par rapport au clade A2a [the other prevalent clade in Inda]. Ceci est souvent désavantageux pour le virus, mais davantage de données [and time] est nécessaire pour voir si c’est réellement le cas », a-t-il ajouté.

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